Im Südtrakt des Gebäudes liegt der Schwerpunkt auf den ersten Anfängen Freistadts. Originalobjekte wie Pechkrug und Hakenbüchse veranschaulichen das Leben in der Stadt, wie es zu mittelalterlichen Zeiten war. Der Wohlstand des damaligen Bürgertums lässt sich von den europaweiten Handelsbeziehungen ableiten – im Museum verkörpern Waagen, Zunfttruhen und Kundschaften diese glanzvolle Epoche. Die neun Etagen im Bergfried widmen sich den Themen Volkskunde und Handwerksgeschichte. Gezeigt werden originale Objekte und Dokumente im Zusammenhang mit Handwerk, Schützenwesen, Brauch und viele mehr. Jede Etage ist einem Themenbereich gewidmet und führt hinauf zur Türmerstube, die mit 40 m Höhe einen Weitblick auf die gesamte Stadt und Umgebung bietet. Außerdem zeigen die Hinterglasmalerei in der Kapelle und Keramik im Gesindehaus die künstlerische Seite des historischen Oberösterreichs.